利用基因组特异性引物和Cas12a介导技术快速检测稻瘟菌小麦致病型

日期:2021.01.01 点击数:0

【类型】期刊

【题名】利用基因组特异性引物和Cas12a介导技术快速检测稻瘟菌小麦致病型

【基金项目】1579

【作者】 康厚祥

【关键词】 稻瘟菌小麦致病型 田间检测 核酸侧流免疫分析 Cas12a 麦瘟病

【期刊名】Engineering

【摘要】麦瘟病由稻瘟菌小麦致病型(MoT)引起,是一种存在于南美洲和孟加拉国的毁灭性病害。由于MoT通常不会在抽穗期之前使小麦显现染病症状,但在抽穗期其侵染会一直加剧,因此仅根据肉眼观察来使用杀菌剂是无效的。为了开发一种在苗期和营养期准确、灵敏检测MoT以控制病害蔓延的方法,我们对来自巴西的两个MoT分离株的基因组进行了测序,并确定了两个DNA片段:MoT-6098和MoT-6099,它们存在于麦瘟病菌(MoT)基因组中,但不存在于感染稻瘟病菌(MoO)的水稻基因组中。利用聚合酶链反应(PCR),我们在来自南美洲和孟加拉国的53株MoT和MoO分离株中证实了这两对标记引物的特异性。为了测试这两对标记引物的有效性,我们首先建立了一种环介导等温扩增(LAMP)方法。在等温条件下,这种方法在不使用常规PCR仪器的情况下也能检测MoT。随后,我们使用Cas12a蛋白及导向RNA(g RNAs)靶向MoT-6098和MoT-6099序列,两个靶标被识别后,均能激活Cas12a非特异切割单链脱氧核糖核酸酶(ss DNAase)的活性,我们将依赖靶向Cas12a激活ss DNase活性,同时将重组酶聚合酶扩增(RPA)和核酸侧流免疫分析法(NALFIA)相结合,开发出一种准确、灵敏且经济高效地检测受感染小麦植株中MoT特异性DNA序列的方法。这种新技术可应用于田间麦瘟病和其他重要植物病害的快速检测。

【年份】2021

【ISSN】2095-8099

【页码】279-299

【期号】9

【作者单位】1State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests,Institute of Plant Protection,Chinese Academy of Agricultural Sciences;2Department of Plant Pathology,The Ohio State University;3Institute of Biotechnology and Genetic Engineering (IBGE),Bangabandhu Sheikh Mujibur Rahman Agricultural University;4Centro de Ciências Agrárias,Universidade Federal de S?o Carlos;5Foreign Disease-Weed Science Research Unit (FDWSRU),United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service (USDA-ARS)

【期刊卷】7

【分类号】S435.121

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